Isaac Peeper was een zoon van Meijer Jesaias Peeper en Marianne Halverstad. Hij trouwde in Amsterdam op 10 Juni 1903 met Betje Roos, een dochter van Nathan Roos en Engeltje Plukker. Het echtpaar kreeg vier kinderen, waarvan één dochter de Holocaust heeft overleefd. De andere kinderen, t.w. Meijer, Nathan en Marianne zijn in de Sjoa vermoord.
Isaac Peeper kwam zelf uit een gezin met zes kinderen. Hij had nog vijf zusters, waarvan één zus in 1929 is overleden. Zijn zusters Alida, Debora en Rachel en Judith zijn tijdens de Sjoa vermoord.
Stadsarchief Amsterdam, archiefkaarten Isaac Peeper, Debora Peeper Rachel Peeper Isaac Peeper en website www.wiewaswie.nl