Joseph Koekoek was een zoon van Levie Koekoek en Berenice Tokki. Hij trouwde op 15 Juni 1938 met Ester Hakker, een dochter van Salomon Hakker en Grietje Porets.
Het echtpaar had geen kinderen.
Gemeente Archief Den Haag, gezinskaart Joseph Koekoek en Burgerlijke Stand Den Haag, overlijdensakte C690 dd 24 Februari 1951.