Ephraim Kukenheim stierf op 31 december 1942 op 79-jarige leeftijd in kamp Westerbork. Hij is op 4 januari 1943 op de joodse begraafplaats in Assen begraven.
Joods Historisch Museum, Documentenverzameling, inv.nr 3397; Overlijdens- en begraafregister van de joodse gemeente Assen
Uit de begraafboeken van de joodse begraafplaats te Assen is bekend dat Ephraim Kukenheim aldaar is begraven.
Deze persoon wordt herdacht op een gedenkteken in Assen. Een beschrijving van dit gedenkteken is te vinden op de website van het Nationaal Comité 4 en 5 mei.