Markus Neuberger woonde vanaf 1940 samen met zijn broer Hermann Zwi in de villa Haimer’s Esch aan de Strootsweg 460 te Enschede, samen met een dertigtal andere joodse bewoners. Markus was daar godsdienstleraar en vanaf 1940 de dagelijkse leiding op zich neemt. In de zomer van 1942 werden beide broers tewerkgesteld in werkkamp ’t Schut, samen met een aantal andere joodse mannen die ondergebracht waren in villa Haimer’s Esch. Hij werd overgebracht op 3-5 oktober 1942 naar kamp Westerbork, barak 64.
Op 2 november 1942 is hij met zijn vrouw Flora Rabinowitz en hun éénjarig zoontje Uri naar Auschwitz gedeporteerd Na aankomst werden Flora en Uri in de gaskamers om het leven gebracht, Markus overleed een half jaar later.